好不容易拿到了自己的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，心情激動(dòng)、躍躍欲試，想趕快去實(shí)施一下自己的idea，可是又不會(huì)寫代碼，只能干等著？當(dāng)然不是，其實(shí)你完全可以實(shí)現(xiàn)不寫代碼完成自己大部分?jǐn)?shù)據(jù)挖掘的工作。

在胚胎發(fā)育過(guò)程中，造血干細(xì)胞（HSCs）需要迅速分化為成熟的血細(xì)胞。當(dāng)前主要通過(guò)小鼠和體外模型系統(tǒng)來(lái)了解胎兒造血干/祖細(xì)胞（HSPCs）。研究表明在發(fā)育過(guò)程中，胎兒的造血功能包括不同器官中稀有造血干細(xì)胞的分化、遷移。人類確定性造血作用始于背主動(dòng)脈造血簇中HSCs的出現(xiàn)，這些HSCs在4 PCW首先定位于胎兒肝臟并進(jìn)行擴(kuò)張，在10.5 PCW時(shí)，造血部位轉(zhuǎn)移至骨髓并建立成人造血功能。

扎根于細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域40余年，BD公司在流式和抗體領(lǐng)域占據(jù)著主導(dǎo)地位。作為目前單細(xì)胞研究常用的技術(shù)之一，BD公司2018年推出的Rhapsody?單細(xì)胞分析平臺(tái)克服了傳統(tǒng)檢測(cè)的局限性，能夠?qū)ι先f(wàn)個(gè)單細(xì)胞的數(shù)千個(gè)表達(dá)基因同時(shí)進(jìn)行定量檢測(cè)，鑒定和表征新型和罕見(jiàn)細(xì)胞類型，有助于理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域的生物學(xué)過(guò)程。

盡管轉(zhuǎn)錄組研究已經(jīng)獲得很多令人激動(dòng)的進(jìn)展，但它終歸還是一個(gè)高度協(xié)調(diào)的、受表觀基因組調(diào)控的基因表達(dá)程序的副產(chǎn)物。

研究人員使用空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)(spatial transcriptome，ST)來(lái)識(shí)別,阻斷腫瘤異質(zhì)性的來(lái)源，提供識(shí)別新的生物標(biāo)志物的能力，并深入了解腫瘤細(xì)胞、脂肪組織、血管、三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)和TME間基質(zhì)之間的動(dòng)態(tài)相互作用。

過(guò)往研究報(bào)道了早期胎兒腸上皮細(xì)胞動(dòng)力學(xué)與IBD之間的聯(lián)系，提示IBD患者的腸上皮中可能重現(xiàn)了類似于胎兒的轉(zhuǎn)錄程序。因此，解讀腸道發(fā)育是預(yù)防和治療此類疾病的關(guān)鍵一步。

DNA甲基化標(biāo)志物作為標(biāo)志物的成功案例有MGMT啟動(dòng)子甲基化可預(yù)測(cè)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤和血漿中甲基化SEPTIN 9(SEPT9)檢測(cè)無(wú)癥狀結(jié)直腸癌，這些都已被納入臨床指南并轉(zhuǎn)化為商業(yè)化臨床試驗(yàn)。

識(shí)別人體器官細(xì)胞的特征及其相互作用對(duì)研究與疾病相關(guān)的生物學(xué)機(jī)制具有重要意義。

擬時(shí)序分析（pseudo-time），它指通過(guò)構(gòu)建細(xì)胞間的變化軌跡來(lái)重塑細(xì)胞隨著時(shí)間的變化過(guò)程。用于擬時(shí)序分析的軟件和算法很多，目前文章中用到多的是Monocle軟件，這也是是CNS主流期刊的常用軟件。

微生物組與代謝組的數(shù)據(jù)整合方法按照是否基于已有知識(shí)可以分為統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)方法和知識(shí)驅(qū)動(dòng)的整合分析方法。