Q：lncRNA 芯片的樣本起始量是多少？
A：
Q：lncRNA 芯片適用于哪些物種？
A：目前我們有三款 SBClncRNA 芯片，分別可以用于檢測(cè)人、小鼠和大鼠的 lncRNA 表達(dá)情況。
Q：SBClncRNA 芯片有哪些優(yōu)勢(shì)？
A：SBC lncRNA 芯片主要有以下幾個(gè)優(yōu)勢(shì)：
（1）采用 Agilent eArray 平臺(tái)設(shè)計(jì)，Agilent SurePrint 技術(shù)合成，檢出率高，技術(shù)重復(fù)性高于 99%；
（2）覆蓋主流 lncRNA 數(shù)據(jù)庫的 lncRNA 信息，可同時(shí)檢測(cè) lncRNA 和 mRNA，便于挖掘兩者之間的關(guān)聯(lián)性；
（3）芯片實(shí)驗(yàn)過程中采用隨機(jī)引物擴(kuò)增的方式，可同時(shí)擴(kuò)增帶 poly- A 和不帶 poly- A 的 lncRNA。
Q：有客戶用 lncRNA 芯片結(jié)果發(fā)表文章的么？
A：有的，lncRNA 近來來是非編碼 RNA 研究的熱點(diǎn)，伯豪助力多位老師利用 lncRNA 芯片發(fā)表影響因子不低的文章，詳見附件 【查看】。
Q：lncRNA 芯片結(jié)果在進(jìn)行定量驗(yàn)證時(shí)，有哪些注意事項(xiàng)？
A：lncRNA 的定量驗(yàn)證方法與 mRNA 基本相同，需要特別注意的是對(duì)于“exonic_sense”來源的 lncRNA，在引物設(shè)計(jì)時(shí)一定要區(qū)分開 lncRNA 和 mRNA。驗(yàn)證過程中需要注意的事項(xiàng)請(qǐng)?jiān)斠姼郊?【查看】 。
Q：如何獲得 lncRNA 的序列信息？
A：我們的 SBC lncRNA 芯片是基于主流 lncRNA 數(shù)據(jù)庫設(shè)計(jì)的，在芯片結(jié)果中我們會(huì)列出每個(gè)探針對(duì)應(yīng)的 lncRNA 詳細(xì)的信息可以直接根據(jù) accession 號(hào)在相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行 lncRNA 序列信息的查找。由于目前 lncRNA 的研究還處在初級(jí)階段，很多 lncRNA 都是預(yù)測(cè)的，因此隨著研究的深入，會(huì)發(fā)現(xiàn)部分 lncRNA 并非真的為 lncRNA。如果芯片結(jié)果里出現(xiàn)某些 lncRNA 在相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫中查找不到序列信息，那么很有可能該 lncRNA 已經(jīng)不被該數(shù)據(jù)庫收錄了。
Q：lncRNA 有哪些研究方向？
A：lncRNA 研究目前可分為 biomarker 研究和分子機(jī)制研究這兩個(gè)方向。 由于 lncRNA 具有組織特異性，且已有相關(guān)研究報(bào)道 lncRNA 在疾病組織和血液中特異性表達(dá)，因此，lncRNA 是一類理想的疾病研究潛在 Biomarker。
lncRNA 可以與蛋白復(fù)合體結(jié)合，調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄；可以影響 mRNA 的穩(wěn)定性和翻譯；可以作為 miRNA 的”sponge”；可以作為 miRNA 的前體分子等。從 lncRNA 的分子作用機(jī)制入手，是目前 lncRNA 研究的熱點(diǎn)。
Q：如何去研究一個(gè) lncRNA 的生物學(xué)功能？
A：目前已知功能的 lncRNA 很少，根據(jù) lncRNA 可以調(diào)控 mRNA 的特點(diǎn)，進(jìn)行 lncRNA 靶基因預(yù)測(cè)，通過靶基因的功能間接推測(cè) lncRNA 的功能。
lncRNA 的靶基因預(yù)測(cè)分為 cis 預(yù)測(cè)與 trans 預(yù)測(cè)。Cis 預(yù)測(cè)的原理是找出 lncRNA 所處染色體位置上下游 10 kb 范圍內(nèi)的蛋白編碼基因。Trans 預(yù)測(cè)先采用 blast 選出序列上與 lncRNA 互補(bǔ)的 mRNA 序列，再利用 RNAplex 計(jì)算兩序列之間的互補(bǔ)能量，篩選出可能穩(wěn)定結(jié)合的 mRNA。
Q：lncRNA 有哪些不同分類？
A：根據(jù) lncRNA 與編碼蛋白基因的關(guān)系，可以把 lncRNA 分為 5 類：
（1）Sense- overlapping：與 mRNA 外顯子有重疊區(qū)，轉(zhuǎn)錄方向一致；
（2）Antisense-overlapping：與 mRNA 外顯子有重疊區(qū)，轉(zhuǎn)錄方向相反；
（3）Bidirectional：與 mRNA 轉(zhuǎn)錄方向相反，轉(zhuǎn)錄起始位置距離在 1kb 內(nèi)；
（4）Intronic：lncRNA 完全落編碼蛋白基因的內(nèi)含子中；
（5）lncRNA 位于編碼蛋白基因的基因間區(qū)。
