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伯豪生物
文獻錦集 | 2021 年 2 月單細胞測序高分文獻匯總
發(fā)布時間:2021-03-10 瀏覽次數(shù):6358
二月份單細胞測序相關(guān)文獻共收集到48篇(IF>9),文末列表中列出文獻發(fā)表期刊、研究方向和技術(shù)平臺等信息,接下來先看看其中5篇。

文章展示

1

【標題】皮膚駐留的先天性淋巴樣細胞聚集形成一種致病性效應(yīng)子狀態(tài)

【平臺】10X

【期刊】Nature(IF=43.1)

【時間】2021-02-03

【摘要】組織駐留的淋巴細胞(ILCs) 能夠維持屏障功能并對局部信號作出反應(yīng)。ILCs 通常根據(jù)其特異性轉(zhuǎn)錄因子和細胞因子的表達分為 ILC1、ILC2 或 ILC3。在皮膚中,IL-23 相關(guān)細胞因子白介素(IL)-17 和 IL-22 對 IL-23 信號的疾病特異性產(chǎn)生會導(dǎo)致牛皮癬的皮膚炎癥。然而,尚不清楚此響應(yīng)是由已確定的 ILC 啟動的,還是由細胞狀態(tài)轉(zhuǎn)換啟動的。研究人員發(fā)現(xiàn)由 IL-23 或咪喹莫特在小鼠中引起的牛皮癬會重置一系列的皮膚 ILC,并逐漸成為致病性 ILC3 樣狀態(tài)。在沒有循環(huán) ILC 的情況下,駐留在組織中的 ILC 是推動病理發(fā)生的必要且充分條件。皮膚 ILC 的單細胞 RNA 測序(scRNA-seq) 圖譜在牛皮癬炎癥過程中形成了一個密集的轉(zhuǎn)錄連續(xù)體 - 即使在穩(wěn)態(tài) - 反映了流體 ILC 狀態(tài),包括初始或靜止?fàn)顟B(tài)和 ILC2 效應(yīng)狀態(tài)。在疾病誘導(dǎo)后,連續(xù)體迅速轉(zhuǎn)移到一個混合的、類似 ILC3 的亞群,該亞群也表達 ILC2s 特有的細胞因子,研究人員推測這是通過多個軌跡產(chǎn)生的,通過體外實驗、轉(zhuǎn)座酶可及染色質(zhì)的單細胞測序(scATAC-seq) 和體內(nèi)命運圖譜,證實了靜態(tài)樣狀態(tài)和 ILC2 態(tài)的轉(zhuǎn)換潛力。這些結(jié)果突出了皮膚 ILC 反應(yīng)的范圍和靈活性,表明在健康組織中引發(fā)的免疫活性可以動態(tài)地適應(yīng)炎癥,如果不加以控制,就會推動病理重塑。


2

【標題】多癌種內(nèi)腫瘤浸潤髓系細胞的單細胞轉(zhuǎn)錄圖譜

【平臺】10X

【期刊】Cell(IF=36.2)

【時間】2021-02-04

【摘要】腫瘤浸潤性髓樣細胞(TIMs)是腫瘤進展中的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,但是在不同腫瘤中其基本特性的相似性和區(qū)別仍然難以捉摸。該研究通過對來自 210 位患者的 15 種人類癌癥類型的單個髓樣細胞進行分析,確定了不同癌癥類型的 TIMs 的獨特特征。鼻咽癌中的肥大細胞與更好的預(yù)后相關(guān),并且表現(xiàn)出具有高比例的 TNF + / VEGFA + 細胞的抗腫瘤表型。cDC1 和 cDC2 衍生的 LAMP3 + cDCs 的系統(tǒng)比較揭示了它們在轉(zhuǎn)錄因子和外部刺激方面的差異。此外,促血管生成的腫瘤相關(guān)巨噬細胞(TAMs)具有跨不同癌癥類型的多種標記物,并且 TIMs 的組成似乎與體細胞突變和基因表達的某些特征有關(guān)。該研究結(jié)果提供了高度異質(zhì)性 TIMs 的系統(tǒng)視圖,并為合理,有針對性的免疫療法提出了未來的途徑。


3

【標題】早期復(fù)發(fā)性肝癌中生態(tài)系統(tǒng)的單細胞圖譜

【平臺】10X

【期刊】Cell(IF=36.2)

【時間】2021-02-16

【摘要】肝細胞癌(HCC) 復(fù)發(fā)率高,5 年生存率低。復(fù)發(fā)性肝癌的單細胞圖譜可能有助于設(shè)計有效的抗癌療法,包括免疫療法。研究人員分析了 18 例原發(fā)性或早期復(fù)發(fā)肝癌患者的 17,000 個細胞的轉(zhuǎn)錄組。與原發(fā)腫瘤相比,在兩個獨立的隊列中,早期復(fù)發(fā)腫瘤的調(diào)節(jié)性 T 細胞水平降低,樹突狀細胞(DC) 增加,浸潤的 CD8+ T 細胞增加。值得注意的是,復(fù)發(fā)腫瘤中 CD8+ T 細胞過表達 KLRB1(CD161),并表現(xiàn)出天然的低細胞毒性狀態(tài),克隆性低,與原發(fā)性肝癌中觀察到的的經(jīng)典耗竭狀態(tài)不同。這些細胞的富集與較差的預(yù)后有關(guān)。差異基因表達和相互作用分析揭示了復(fù)發(fā)腫瘤細胞中潛在的免疫逃避機制,這些機制抑制了 DC 抗原提呈,并招募了先天類 CD8+ T 細胞。該研究對 HCC 生態(tài)系統(tǒng)的全面描述提供了對與腫瘤復(fù)發(fā)相關(guān)的免疫逃避機制的更深入的了解。


4

【標題】膽管細胞類器官可以在人肝移植后修復(fù)膽管

【平臺】10X

【期刊】Science(IF=41.037)

【時間】2021-02-19

【摘要】類器官培養(yǎng)技術(shù)在再生醫(yī)學(xué)方面具有廣闊的前景,但尚未應(yīng)用于人類。研究人員在膽管病的情況下使用膽管細胞類器官來解決這一挑戰(zhàn),這是肝移植的一個關(guān)鍵原因。利用單細胞 RNA 測序,研究人員發(fā)現(xiàn)原代人膽管細胞表現(xiàn)出在器官培養(yǎng)中丟失的轉(zhuǎn)錄多樣性。然而,膽管細胞類器官仍然是可塑性的,當(dāng)被移植回膽道樹時,它們會恢復(fù)體內(nèi)的特征。然后,研究人員利用體外常溫灌注的人肝細胞植入模型來證明,這一特性允許肝外有機體修復(fù)移植后的人肝內(nèi)導(dǎo)管。該研究結(jié)果為膽管細胞有機體可用于修復(fù)人膽管上皮提供了理論依據(jù)。


5

【標題】單細胞測序鑒定復(fù)發(fā)性多發(fā)性骨髓瘤耐藥途徑和治療靶點

【平臺】MARS-seq

【期刊】Nature Medicine(IF=30.64)

【時間】2021-02-22

【摘要】多發(fā)性骨髓瘤(MM)是一種以惡性漿細胞克隆性增殖為特征的漿細胞腫瘤性疾病。盡管進行了廣泛的研究,但對耐藥性患者內(nèi)部和之間的疾病異質(zhì)性的表征卻很少。在本研究中,研究人員進行了一項前瞻性,多中心,單向臨床試驗(NCT04065789),并結(jié)合縱向單細胞 RNA 測序(scRNA-seq)來研究 MM 耐藥機制的分子動力學(xué)。對接受含硼替佐米誘導(dǎo)方案治療后無反應(yīng)或經(jīng)歷早期復(fù)發(fā)新確診 MM 患者(41)的研究來評估達雷木單抗、卡非佐米、來那度胺和地塞米松聯(lián)合治療的安全性和有效性。主要臨床終點是安全性和耐受性。次要終點包括總體緩解率、無進展生存期和總體生存期。治療安全且耐受良好,獲得了有效而持久的療效。在預(yù)先進行的探索性分析中,對 41 例原發(fā)性難治性和早期復(fù)發(fā)患者與 11 例健康受試者和 15 例新診斷的 MM 患者進行了比較,發(fā)現(xiàn)了新的 MM 耐藥分子途徑,包括耐缺氧,蛋白折疊和線粒體呼吸,其適用于更廣泛的臨床人群(CoMMpass)。研究發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)折疊反應(yīng)途徑的核心酶肽基脯氨酰異構(gòu)酶 A(PPIA)是耐藥性 MM 的潛在治療新靶標。利用 CRISPR– Cas9 敲除 PPIA 或用小分子抑制劑(環(huán)孢菌素)抑制 PPIA 可顯著增強 MM 腫瘤細胞對蛋白酶體抑制劑的敏感性。該研究確定了在臨床試驗中整合 scRNA-seq 的路線圖,確定了高耐藥 MM 患者的特征,并發(fā)現(xiàn) PPIA 是這類腫瘤的有效治療靶點。


文章列表

下表列出 48 篇文獻信息,一起看看有沒有您關(guān)注的研究方向,掃描下方二維碼獲取文獻原文。

單細胞測序 2


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