伯豪生物單細胞核產(chǎn)品加服務(wù): 帶你乘風(fēng)精準(zhǔn)研核,發(fā)文章沖擊國自然!
伯豪生物單細胞核轉(zhuǎn)錄組測序(single-nucleus RNA sequencing,snRNA-seq)是從組織抽提細胞核,然后在單個細胞核水平上對轉(zhuǎn)錄組進行高通量測序分析的一項新技術(shù),通過檢測單個細胞核的基因表達狀態(tài),進而揭示細胞間的異質(zhì)性。
技術(shù)流程
單細胞核 RNA 測序(snRNA-seq)的優(yōu)勢
1)冷凍組織可以用于直接抽提細胞核,為臨床回顧性研究中單細胞測序的開展提供了解決方案。
2)有些組織通過酶解消化很難拿到高質(zhì)量的細胞懸液,通過抽提細胞核,避開酶解消化,是一個更好的選擇。
3)適用于對解離酶敏感(如神經(jīng)元、肝實質(zhì)細胞)、直徑較大、形狀不規(guī)則(如心肌細胞)等特殊細胞類型。
4)直接從組織抽提細胞核,不需要酶解消化及恒溫孵育,避免了組織解離過程中誘導(dǎo)應(yīng)激基因的表達。
伯豪生物單細胞核 RNA 測序優(yōu)勢
1、高質(zhì)量抽核:抽核經(jīng)驗豐富,針對不同組織優(yōu)化了解決方案;
2、標(biāo)準(zhǔn)化內(nèi)控:豐富的實操經(jīng)驗構(gòu)建了標(biāo)準(zhǔn)化的內(nèi)控體系;
3、流程化分析:完善的分析流程,準(zhǔn)確快速解析單細胞核轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù);
4、專業(yè)化團隊:資深的技術(shù)團隊具有多年項目方案設(shè)計、實驗操作、售后分析等經(jīng)驗;
5、全流程服務(wù):提供組織抽核、單細胞核捕獲、反轉(zhuǎn)錄、建庫測序及數(shù)據(jù)分析的全套服務(wù)。
伯豪生物豐富的單細胞核抽提經(jīng)驗
利用自主研發(fā)的“伯優(yōu)細胞核分離試劑盒”已經(jīng)完成大腦皮層、下丘腦、海馬、延髓、松果體、肝臟、心臟、膠質(zhì)瘤、骨、乳腺和胰腺等 20 多種組織的抽核制備及上機測序。
送樣要求
1、組織用量:黃豆粒大小 1 塊;
2、樣本處理:組織液氮速凍,-80℃保存;
3、質(zhì)量要求:組織 RNA 無降解,RIN≥7;
4、運輸方式:干冰運輸。
應(yīng)用方向
冷凍樣本;通過消化難拿到高質(zhì)量的單細胞懸液的組織類型。
結(jié)果展示
1)腦組織
▲腦組織 snRNA-seq 細胞類群注釋結(jié)果
腦組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:神經(jīng)元(Neurons)73.0%;星形膠質(zhì)細胞(Astrocytes)9.4%;少突膠質(zhì)細胞(Oligodendrocytes)9.2%;內(nèi)皮細胞(Endothelial cells)6.7%;小膠質(zhì)細胞(Microglial cells)1.4% 及嗅鞘膠質(zhì)細胞(Olfactory ensheathing glia)0.4%。
2)心臟組織
▲心臟組織 snRNA-seq 細胞類群注釋結(jié)果
心臟組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:心肌細胞(Cardiomyocytes)38.8%;內(nèi)皮細胞(Endothelial cells)30.3%;成纖維細胞(Fibroblasts)16.6;神經(jīng)元細胞(Neuronal cells)6.3%;巨噬細胞(Macrophages)6.0%;Monoblasts 0.8%;間皮細胞(Mesothelial cells)0.6%;T 和 B 細胞分別占 0.4%;中性粒細胞(Neutrophil cells)0.4%;脂肪細胞(Adipocytes)0.2% 及髓細胞(Myeloid cells)0.1%。
3)肝臟組織
▲肝臟組織 snRNA-seq 細胞類群注釋結(jié)果
肝臟組織 snRNA-seq 各種細胞類型比例:肝細胞(Hepatocytes)56.0%;內(nèi)皮細胞(Endothelial cells)10.9%;膽管細胞(Cholangiocytes)9.4%;成纖維細胞(Fibroblasts)9.2%;星狀細胞(Stellate cells)8.7%;T 細胞 4.7% 及 B 細胞 1.1%。
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